| Nome | Tipo | Popolazione 2021 | Fonte |
|---|---|---|---|
| Manfredonia | frazione | 50.770 | istat bt2021 |
| Località D32 | frazione | 534 | istat bt2021 |
| Scalo dei Saraceni | frazione | 425 | osm |
| Mezzanone | frazione | 424 | istat bt2021 |
| Sciali di Lauro | frazione | 359 | osm |
| Ippocampo | frazione | 324 | osm |
| Sciali degli Zingari | frazione | 174 | osm |
| San Salvatore | frazione | 118 | osm |
| Posta del Fosso | localita | 45 | istat bt2021 |
| Zona A.S.I. | localita | 22 | istat bt2021 |
| Zona P.I.P. D46-D49 | localita | 15 | istat bt2021 |
| La Bussola | frazione | 13 | osm |
| Area Industriale Ss 159 | localita | 11 | istat bt2021 |
| Masseria Barretta | frazione | 8 | istat bt2021 |
| Tomaiuolo | frazione | 6 | istat bt2021 |
| Feudo della Paglia | frazione | 1 | istat bt2021 |
| Amendola | frazione |
| Barretta | frazione |
| Borgo Mezzanone | frazione |
| Quartiere ANAS | localita |
| Siponto | quartiere |
| Tomaiolo | frazione |