| Nome | Tipo | Popolazione 2021 | Fonte |
|---|---|---|---|
| San Gimignano | frazione | 3.031 | istat bt2021 |
| Badia a Elmi | frazione | 850 | osm |
| Ulignano | frazione | 647 | osm |
| Santa Lucia | frazione | 270 | osm |
| Casa Reclusione San Gimignano | frazione | 167 | istat bt2021 |
| Castel San Gimignano | frazione | 141 | osm |
| Pancole | frazione | 80 | osm |
| Monteoliveto | frazione | 32 | osm |
| Montauto | frazione | 16 | osm |
| Cusona | localita | 14 | osm |
| San Donato | frazione | 12 | osm |
| Aiano | frazione |
| Borgo Storico Santa Lucia | frazione |
| Centro storico di San Gimignano | localita |
| Ciuciano | frazione |
| Collemucioli | frazione |
| Cortennano | frazione |
| Fattoria di Vagli | frazione |
| Fugnano | frazione |
| Il Caggio | frazione |
| Il Piano | frazione |
| La Piazzetta | frazione |
| Larniano | frazione |
| Le Balze | frazione |
| Libbiano | frazione |
| Pescille | frazione |
| Picchena | frazione |
| Ranza | frazione |
| Santa Chiara | localita |
| Torraccia di Chiusi | frazione |